香港大學指工程學院電機電子工程系教授謝堅文領導跨學科研究團隊開發一種能處理龐大數據並作出精準推算的新計算工具,一些內地和海外科研團隊已應用於新冠病毒研究,追蹤人體接種疫苗後對不同病毒的免疫反應;研究成果已於學術期刊《自然通訊》內發表。
研究成員暨李嘉誠醫學院生物醫學學院副教授何永基表示,目前有各種具高精準度的「組學技術」去收集有關單細胞的多方面信息,但這些計算方法都無法處理龐大(超過數百萬個細胞)的複雜單細胞組學數據,很多時僅用來分析某一項特定細胞特徵,故科研人員一直缺乏有效解決方案對細胞發展作全面軌跡推斷。
謝堅文解釋,細胞在正常健康和疾病過程中演變成不同細胞狀態和類型,而要準確預測演變軌跡以了解身體如何正常發育和如何染病等,研究團隊需有能力測量和分析每個細胞的所有相關特徵。
據了解,名為VIA的新軌跡推理算法是利用一種新「無監督式」機器學習方法,模擬人類思維過程,像人腦般發掘數據背後的邏輯規律作推敲;團隊更收集包括單細胞蛋白質組學、基因相關和其他生物訊息的組學數據,對各個重要生物過程作全面分析研究。(圖為李嘉誠醫學院生物醫學學院副教授何永基和工程學院電機電子工程系教授謝堅文。)