研究發現:華南海鮮市場非新冠病毒始發地

2020-02-23
来源:香港商报

   【香港商報网訊】據中新社昨日消息,中國科學院西雙版納熱帶植物園官方網站稱,該園聯合華南農業大學和北京腦科中心,收集了全球共享到GISAID EpiFluTM數據庫中樣本覆蓋四大洲12個國家的93個新冠病毒樣本基因組數據(截至2月12日),通過全基因組數據解析發現,武漢華南海鮮市場的新型冠狀病毒是從其它地方傳入。

  去年11月份已開始人傳人

  據悉,93個樣本包含58種單倍型,演化關係顯示,單倍型H13和H38是比較「古老的」單倍型,通過一個中間載體(mv1,可能是祖先單倍型,也可能是來自中間宿主或「零號病人」)與蝙蝠冠狀病毒RaTG13關聯,並通過單倍型H3衍生出單倍型H1。

  研究人員稱,與華南海鮮市場有關聯的患者樣品單倍型都是H1及其衍生單倍型H2,H8-H12,而一份武漢樣品單倍型H3與華南海鮮市場無關。可見,華南海鮮市場的新冠病毒是從其它地方傳入,再在市場發生快速傳播並蔓延,並傳播到整個城市。另根據病患發病時間記錄和種群擴張時間推斷,也印證了華南海鮮市場不是病毒發源地的推論。

  研究人員對H13和H38的病毒樣品溯源發現,分別來自深圳的病患(廣東首例)和美國華盛頓州的病患(美國首例)。他們的旅行記錄表明都是2019年12月底至2020年1月初到武漢探親,可能在此期間被感染。現有武漢樣本中沒有檢測到H13和H38單倍型。

  研究者稱,因為現有樣品主要採自幾家定點醫院,且樣品採集時間有所局限,可能導致沒發現武漢當地H13和H38的患者樣本。若在早期的病患檢測到這兩種單倍型,對病毒溯源會有很大幫助。

  研究還顯示,新冠病毒在2月12日前發生過2次明顯種群擴張:一次是2019年12月8日,該結果暗示病毒可能在12月初,甚至11月下旬已開始人際傳播,隨後在華南海鮮市場加快;另一次種群擴張發生在1月6日。

  病毒基因組尚未發生重組事件

  值得一提的是,為細分來源,研究人員將58種單倍型分成五組,包括3個古老超級傳播者單倍型(H1、H3和H13)和2個新的超級傳播者單倍型(H56和mv2)。以此鑒別出廣東的病毒可能有三個來源,重慶和台灣的病毒有兩個來源。其中,廣東深圳一家人在早期就通過人傳人進行了傳播。有較多樣本的澳大利亞、法國、日本和美國,患者感染源至少有兩個,尤其是美國包括了五個來源。

  特別值得關注的是H56這個超級傳播者單倍型,同時是澳大利亞、法國和美國以及中國台灣患者的傳染源。其他國家患者因為樣品比較少,大多數的來源比較單一,他們除了是武漢旅遊輸入或在武漢感染外,有一些人可能是在廣東、新加坡等地被感染。

  研究還表明,新冠病毒基因組沒有發生重組事件。他們在8個蛋白質編碼區發現了120個核苷酸突變點位,基因組中的10個蛋白質編碼區的突變點位均勻分布。120個突變的核苷酸關聯了119個氨基酸密碼子,其中79個密碼子 (65.83%)改變了氨基酸類型,並有42個(53.17%)氨基酸理化性質都被改變。

  目前研究者尚不清楚這些氨基酸類型以及理化性質改變是否會影響新冠病毒的活性,需要其他蛋白組學和結構生物學方面的專業人士進行驗證。

[责任编辑:郭玉桔]
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