【香港商報网訊】記者林麗青報道:世界衛生組織(WHO)近日宣布新冠肺炎疫情具有全球大流行特徵。16日,深圳國家基因庫與全球共享流感數據倡議組織(GISAID)達成戰略性合作。雙方將圍繞呼吸道傳染病相關病毒的基因數據管理、共享、分析等方面展開全面合作,促進病毒數據的全球共享。國家基因庫生命大數據平台成為GISAID的中國首個正式授權平台。
深圳國家基因庫展區展示收集的各種生物樣本。
圖為市民參觀國家植物基因庫深圳活體庫。
助快速應對全球性流感
2008年建立的GISAID是目前全球最大的流感及新型冠狀病毒數據平台。中國在抗擊嚴重急性呼吸綜合徵(SARS)、甲型HIN1流感、人感染H7N9禽流感、COVID-19等疫情中發揮了重要作用。目前世界各地的研究團隊正共同努力、積極開展新型冠狀病毒的相關研究,包括病毒的自然史、流行病學、疫苗、診斷試劑、治療工具等。
截至3月13日,美國國家生物技術信息中心(NCBI)文獻庫收錄的各類新型冠狀病毒的研究文章已達800+篇,中國臨床試驗註冊中心網站新型冠狀病毒肺炎臨床研究索引顯示的註冊實驗已有393項。
本次戰略合作將幫助中國科研工作者獲得一站式病毒數據資源訪問服務和更加豐富的分析工具,也標誌?中國科研機構在合規合法、保護數據生產者和提交者權利的前提下,促進全球範圍新型冠狀病毒及流感數據共享方面邁出重要一步。
全球共享流感數據倡議組織倡導的數據共享機制,在維護全球公共安全方面發揮?重要作用,通過幾乎即時的監測,可快速應對和緩解季節性流感和全球大流行性流感,以及目前的新型冠狀病毒全球大流行。GISAID的數據來源於全球14000名研究人員和1500個機構,其獨特的數據共享機制可以促進相關研究取得快速進展,例如推動對COVID-19的認知和相關醫療對策的研發。截至3月13日,全球共享流感數據倡議組織針對新型冠狀病毒開發的EpiCoVTM數據庫,目前已收錄656條新型冠狀病毒序列數據,已超越傳統的數據平台。同時,傳統數據平台(比如公有領域的數據庫)因允許匿名訪問而導致數據所有者權益不受保護、數據使用不透明的問題,在GISAID的數據共享機制中不復存在。
國家基因庫生命大數據平台作為國內最大的生物大數據中心之一,匯集了國家基因庫及全球其他重要數據源的公開數據,同時提供可信共享計算平台等多種應用工具。在本次新冠肺炎疫情中,截至3月13日,國家基因庫生命大數據平台已經匯總了國家基因庫歸檔及NCBI的病毒序列數據資源159條。