關注疫情防控消息的市民不難發現，深圳通報疫情防控最新情況時，還會公布確診病例所屬的變異毒株。6月14日及6月18日確診的3名病例經新冠病毒基因測序，確定為新冠病毒Delta變異株（B.1.617.2），與國際航班CA868境外輸入陽性病例高度同源。

　在這些通報中，一些專用名詞不免令普通市民有些疑惑。什麼是基因測序？測得幾個病例高度同源又有什麼意義？近日，深圳市疾控中心新冠溯源團隊接受媒体採訪，揭秘新冠病毒基因測序工作那些不為人知的故事。

　無縫隙操作 24小時完成病毒基因測序溯源

　「對於覆核確診的陽性樣本，我們會做病毒基因溯源，來確定病毒的基因型別。」深圳市疾控中心新冠溯源團隊研究員何雅青表示，深圳市疾控中心承擔了全市新冠病毒陽性樣本覆核工作。全市醫院、第三方檢測機構80餘個一旦初步篩查出疑似陽性的樣本，就會將病例樣本送到深圳市疾控中心新冠確診實驗室。實驗室對樣本進行覆核，確認樣本是否陽性。工作人員確認陽性且病毒載量較高的樣本，就會馬上開展新冠病毒基因溯源工作。

　深圳市疾控中心新冠溯源團隊呂子全博士介紹，通過檢測新冠病毒的全基因組序列，再將這個序列通過算法與數據庫中的數據進行比對，可以初步判斷其地域來源。將序列與既往病例序列進行比對，如果序列在同一進化樹分支上，則可以判斷這些病例是否來自同一傳播鏈或傳染源。

　「我們整個溯源流程包括了樣本的準備、文庫的構建、測序和生物信息學分析等步驟，每個步驟之間都要求工作人員做到『無縫隙連接』。」何雅青介紹，新冠病毒樣本送到實驗室後，一般需要經過多個步驟完成檢測。在接到陽性樣本後，工作人員首先進行覆核工作，對樣本進行核酸提取，再用兩種試劑進行核酸檢測。覆核陽性的核酸，分別進行二代和三代序列測定，為病毒溯源工作設置「雙保險」。

　病毒基因序列測定完成後，工作人員還要馬上進行生物信息學分析，將病毒序列與數據庫中的序列進行比對，查看有無變異位點，進行同源性比較。完成數據比對後，還要及時撰寫溯源報告。「國家對二代測序工作要求的時長是72小時，經過我們團隊的不斷優化，現在二代測序的結果24小時就出來了。」何雅青說。

　6月15日下午6點，工作人員經過24小時的無間斷銜接，高效完成溯源工作，最終提交溯源報告：確定姜某的新冠病毒與6月10日CA868國際航班報告的3例境外輸入陽性病例的結果高度同源，均為新冠病毒Delta變異株（B.1.617.2），可判定姜某為該航班境外輸入的關聯病例。

　壓縮測序時間 只為給市民一個安心

　「無縫隙連接」的工作方式是深圳市疾控中心得以快速確認基因測序結果的主要原因。何雅青也坦言，推行這樣的工作方式並非毫無阻力。

　「有些同事不理解，為什麼我們要這麼着急忙慌，多一個小時和少一個小時有區別嗎？其實每個型別的重要程度不太一樣，比如世界衛生組織比較關注的Alpha、Beta、Gamma和Delta這幾個變異毒株，需要我們重點關注。對於它們，我們採取的防控措施也是不同的。」何雅青說，溯源的意義在於專業人員可以通過序列測定確定病毒的型別，這對及時研判疫情、採取有效的防控措施有重要的指導意義。深圳市第三人民醫院也會針對不同變異毒株分區收治，精準管理。

　「有時候我也跟我們科室的人說，我們溯源圖的啥，我們不就是在需要我們的時候為深圳市人民作貢獻。」何雅青認為，多一個小時和少一個小時，區別很大。越快向外界公布溯源結果，越能讓市民安心地在後方生活、工作。「新冠疫情以來，病毒學越來越得到人們的重視。在國家需要我們的時候，我們就要把工作做好、做到極致。只有這樣，才能以最快的速度把結果反饋給深圳市民，讓他們知道是怎麼回事，至少能讓大家心安一些。」何雅青說。

　重任在肩 他們找到了工作的樂趣

　「很多老百姓其實都不知道我們這些幕後工作者。」何雅青介紹，溯源團隊工作人員大多都是90後。在疫情發生後，他們身負重任，不分白天黑夜，不分節假日，熬夜加班是家常便飯。他們一方面要承擔日常的監測、信息報送工作，另一方面則積極投身新冠病毒溯源工作中，在緊急情況下還承擔了對健康人群的篩查工作。但他們依然克服重重困難，為深圳的防控工作作貢獻，也從中找到了疾控人的樂趣。

　「我經常說我們是雖苦尤樂，雖然很苦，但是我們也很快樂。」何雅青說，每完成一次溯源工作，判斷出病毒的源頭，團隊都會深感自豪。如在「521」疫情中，團隊經基因測序，判斷16個案例的病毒基因高度同源，均屬於新冠病毒Alpha毒株，與廣州的疫情病例沒有關聯。結果一出，團隊成員都鬆了一口氣，也為自己奉獻的力量感到快樂。

　「一旦出現了新的病例，大家都會及時快速地投入到緊張的溯源工作中，我們快速的反應其實就可以平息很多的猜測，可以解除人們的一些恐慌。」何雅青說，從疫情開始至今，團隊在每一次重大事件的應對、溯源都很成功。團隊現在還建立了自己的數據庫，一旦出現疫情，工作人員就可以從中提取數據，與新增案例進行比對。

　在「521疫情」期間，團隊還幫助香港進行序列比對。令何雅青感到自豪的是，通過1個小時的序列分析與比對，團隊骨幹成員陳龍就判斷出，香港一例陽性病例的Alpha株的序列和「521疫情」的病毒序列屬於不同來源，兩者沒有關聯。在得到這一信息後，香港媒體也很快公布這個消息。「我和團隊成員都很熱愛自己的工作，並從中找到了屬於疾控人的樂趣和意義，這也是支撐我們走下去的原因。」何雅青說。